Генерал-майор Емил Тонев е роден през 1970 г. в гр. Хасково.

Завършва Военния факултет на Националната спортна академия с магистърска степен през 1993 г. Майстор на спорта по кикбокс.

През 1995 г. постъпва на работа в системата на МВР. В продължение на три години е асистент във Висшия институт за подготовка на офицери и научно-изследователска дейност (ВИПОНД-МВР). От 1997 г. до 1999 г. работи в Бюрото за оперативно издирване (БОИ-МВР), а от 1999 г. до 2004 г. - в Дирекция „Национална служба сигурност“ (ДНСС-МВР), където заема оперативни длъжности.

През 2004 г. е назначен на кадрова военна служба в НСО, като последователно заема длъжностите инспектор, старши инспектор, главен инспектор, началник на сектор и началник на отдел.

Повишаван в поредно офицерско звание, както следва:

2004 г. – капитан

2007 г. – майор

2012 г. – подполковник

2016 г. – полковник

2020 г. – бригаден генерал

2024 г. - генерал майор

През 2000 г. завършва едногодишен курс за първоначална подготовка на офицери по национална сигурност в Академията на МВР, а през 2003 г. - двумесечен курс в Международна правоохранителна академия (ILEA) в Будапеща, Унгария.

През 2007 г. полк. Тонев завършва курс „Дипломатическа сигурност“, „Лична и постова охрана“ в ILEA, Будапеща, Унгария; през 2012 г. - курс „Охрана на високопоставени личности“ в Дирекция за международно сътрудничество на френската полиция в Ойсел, Франция , а през 2014 г. - курс „Дипломатическа сигурност“, „Разкриване на враждебно наблюдение“, Атина, Гърция .

През 2018 г. завършва стратегически курс с квалификация „Изпълнение на ръководни длъжности в системата за национална сигурност и отбрана“ във Военната академия „Георги Ст. Раковски“.

С Указ № 241/13.07.2016 г. на Президента на Република България е назначен за заместник-началник на Националната служба за охрана.

С Указ на държавния глава от 29.07.2020 г. е назначен за изпълняващ правомощията на Началник на НСО.

С Указ № 177/21.08.2020 г. е назначен на длъжност Началник на Националната служба за охрана и е удостоен с висше офицерско звание „бригаден генерал“.

С Указ № 218/20.08.2024 г. на Президента на Република България е удостоен с висше офицерско звание „генерал-майор“.